Introduccion
La Dra. Liz Diaz me invitó a participar del Segundo Simposio El Poder de la Mujer en las Ciencias, el 15 y 16 de abril de 2021. Se supone que para presentar los programas de ciencia de computos. Pero su invitación y el tema de la conferencia me hicieron pensar en el rol de las mujeres en mi carrera como cientifico de cómputos.
Volanta del Segundo Simposio El Poder de la Mujer en Las Ciencias. Pequeñas fotos de muchas cientificas sobre el texto del anuncio.
Para el simposio, prepare una presentación corta, pero creo que me gustaría desarollar algunos de los temas aquí en mi blog.
Conchita Zuazaga, PhD
Foto de la Dra. Zuazaga (izq) y Dra. Steinacker (der) frente a una DEC PDP-12 (izq) y un aparato de electrofisiologia (der).
La Dra. Zuazaga es mi mamá, y la primera mujer en la ciencia que conocí. Ella programó su análisis de datos para su tesis en FORTRAN, y sometía sus programas por correo a una computadora en Minnesota.
Luego obtuvo una de las menos de 800 computadoras DEC PDP-12 que se fabricaron. Esta computadora de 12 bits tenia alrededor de 4 kilo-palabras de memoria. La computadora estaba especializada para trabajar con equipo de laboratorios, y combina una DEC PDP-8 con un LINC. El LINC es una computadora hecha para experimentalistas, con el apoyo de los Institutos Nacionales de la Salud.
Yo aprendi a cambiar las cintas, entrar programas en binario en el panel de bits, e interactuar con la computadora en el teletipo, para jugar SPACEWAR!
Por una tarea que me dio la colega Patricia Ordonez, PhD me enteré que una de las programadoras principales de la computadora LINC fue Mary Ellen Wilkes, Wilkes desarollo el ensamblador y el editor del LINC, y hasta el sistema operativo LAP6, convirtiendo el LINC en un sistema que se podia utilizar para desarollo de programas cientificos. Este sistema se considera la primera computadora personal, y fue construido durante la decada de los 1960's.
Yo no publiqué con la Dra Zuazaga, pero ella si obtuvo publicaciones con la PDP-12.
- Steinacker, A., & Zuazaga, D. C. (1981). Changes in neuromuscular junction endplate current time constants produced by sulfhydryl reagents. Proceedings of the National Academy of Sciences, 78(12), 7806-7809.
Elsa Ortiz Suarez
Cuando yo estaba en la high, mi libro de geometría tenia unos ejemplos de BASIC, y podiamos hacer ejercicios para la clase. Mi Titi Elsa trabajaba en sistemas de informacion (desarollo partes del sistema de matricula), y me llevo a la biblioteca de la escuela de medicina, donde podia usar BASIC en los teletipos conectados al mainframe IBM en el sotano.
Susan Corey, PhD
Ya en la universidad, la Dra Corey me prestó un floppy con WordStar y su Apple II para pasar unos trabajos de mi clase de humanidades, que habia que entregar a maquinilla, sin errores. Poco a poco, desarolle experiencia para entender WordStar, y resolver problemas con WordStar, o floppies, o las Apple. Esto llevo a que me ofrecieran un trabajo en el Instituto de Neurobiología, dando apoyo tecnico a los investigadores, y eventualmente a mi carrera como tecnico de computadoras.
A la profesora desconocida
En la UPR, tome el curso MATE 3028 - Introduccion a la Programacion (dos veces, la primera me colgue). Ponché tarjetas de papel de 80 columnas, que se entregaban en Facundo Bueso, y horas despues recibia los resultados de mi corrida, que incluian la noticia de que me faltaba un punto y coma (;) en la linea 20. La segunda vez, utilizamos terminales de cristal, donde podiamos revisar los programas, compilarlos y correrlos al instante. Esta vez, la pase con A, en parte gracias a la paciencia de la profesora, pero no recuerdo su nombre.
Adriana Baez, PhD
La Dra. Baez trabajaba con drogas anti-cancer, y me recluto a su laboratorio como estudiante subgraduado de quimica, para continuar proyectos con el agente intercalante NBQ. Luego de un incidente en el laboratorio donde se dano un experimento. Ella me pidio que utilizara el sistema Prophet de NIH para hacer diagramas de estructuras quimicas en 3D. El sistma se utilizaba por modem acustico con una llamada de larga distancia a NIH, antes de que existiera el Internet. Con Prophet y Grateful Med (para buscar informacion bibliografica, lo que es PubMed ahora) entre en los precursores de los servicios de computacion cientifica en Internet.
Rosemarie Plaetke, PhD
La Dra. Plaetke es epidemiologa genetica, y trabajaba en mapas geneticos del cromosoma 3 y 8. Me recluto a su laboratorio a mediados de los 1990's, donde desarollé programas para seleccionar marcadores genéticos y crear mapas genéticos. Yo era estudiante graduado en ciencia de computos, y los programas que cree con Dra. Plaetke son los programas de los cuales mas satisfaccion siento. Los problemas que tratamos de resolver, y sus soluciones son bien elegantes.
- H. Ortiz-Zuazaga, and R. Plaetke. Screening genetic markers with the maximum weighted clique method. Abstract presented at the First International Conference on Computational Molecular Biology. Albuquerque, NM, January 1997.
Sandra Peña de Ortiz, PhD
Mi esposa, la Dra. Sandra Peña. Llevamos mas de 30 anos colaborando en la vida, y el primer capitulo de mi tesis doctoral se basó en el analisis de un experimento de su laboratorio. Ella hacia experimentos para medir expresion genetica luego de entrenar roedores, y yo colabore en el analisis de datos de microarreglos. Aun trabajo en analisis de expression genetica, pero ahora en experimentos de RNA-Seq con otros colaboradores, pero muchas de las tecnicas de analisis son iguales.
- Y. Robles, P. E. Vivas, H. G. Ortiz-Zuazaga, Y. Felix, S. Peña de Ortiz. Hippocampal gene expression profiling in spatial learning. Neurobiology of Learning and Memory. 2003 Jul;80(1):80-95. doi:10.1016/S1074-7427(03)00025-X
Patricia Ordoñez, PhD
Patti ha sido mi colaboradora en muchos proyectos desde que llegó a nuestro departamento. Ella me mantiene ocupado con los proyectos de ciencia de datos, y fue de las primeras personas en colaborar conmigo en la educacion informal en ciencia de datos y los Carpentries. Esto resulto en mi primer capitulo de un libro.
- Ordóñez Franco P., Pérez Hernández M.E., Ortiz-Zuazaga H., García Arrarás J. (2020) Building a Data Science Program Through Hackathons and Informal Training in Puerto Rico. In: Celi L., Majumder M., Ordóñez P., Osorio J., Paik K., Somai M. (eds) Leveraging Data Science for Global Health. Springer, Cham. https://doi.org/10.1007/978-3-030-47994-7_29
Muchas colaboradoras
Creo que he sido afortunado de trabajar en bioinformatica, que de las areas de ciencia de computos, tiene mas contacto directo con biologia. Muchas de mis co-autores han sido mujeres. Estoy muy agradecido de su colaboracion, los problemas interesantes que comparten conmigo, y de poder contribuir a su ciencia con el analisis de los datos.